環顧全球發展趨勢，企業界為因應經濟不景氣，紛紛實施人事緊縮與組織扁平政策。使得昔日以專業經理人自許的傳統企管碩士，在求職時受到嚴重波及。就在此時，另一種結合管理、科技、法律的「科技管理」新思潮，正在歐美知名商管學院中應運而生，並儼然逐漸取得理論界與實務界主流優勢地位。
政大籌備科管所時就把「創新」列為教學與研究的主題，並以美國管理協會的領域分類「科技與創新管理」（Technology and Innovation Management, TIM）為所的名稱，而非一般的MOT（Management of Technology），政治大學商學院科技管理研究所，在這樣的環境中於民國八十三年誕生了！配合社會的需求，以培養台灣高科技產業、政府部門與研究機構所需要之經營管理人才為基本使命。所謂高科技產業，係包括資訊、電子、通訊、光電、半導體、生化、醫療、材料、石化、自動化、精密機械、航太等行業，而週邊產業則是指科技政策幕僚、產業技術研發機構企劃人才、高科技產業研究人才、創業投資與科技行銷所需之專業人才等。
政大科管所以學習、合作、創新為「所訓」，希望短時間內在商管學界能脫穎而出，從個人創造思考，團隊、組織的創新、新產品、新事業的創新、產業的創新到國家創新系統，都是政大科管所教學與研究的主題。科管所成立後發展迅速，在成立碩士班四年後於民國八十七年設立博士班，並於同年成立科技企家班。緊接著民國八十九年成立EMBA科管組，九十年成立理工醫農碩士後MBA組，民國九十一年即將設立智慧財產研究所。而其間積極推動校際、國際、兩岸交流合作，與工業技術研究院、陽明大學、麻省理工學院、北京大學、北京清華大學、中國科學院等學術重鎮建立合作交流關係。
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